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Durante dos meses se muestrearon aves en el humedal Juan Amarillo a lo largo de 9 transectos que representaban los hábitats para aves presentes en este ecosistema: Juncal-eneal, vegetación acuática, árboles de la ronda y aguas abiertas. Se describieron los hábitats para aves y se determinó la presencia de especies a lo largo del muestreo, así­ como su abundancia relativa, y abundancia por hábitat. En total se encontraron 41 especies de aves y se reportan 5 registros nuevos para el humedal. El hábitat más utilizado es el árboles de la ronda, esto por la presencia de especies generalistas, pero también se encuentran especies muy especialistas e importantes como Rallus semiplumbeus. Se deben adoptar medidas para detener la degradación ambiental del humedal y conservar la diversidad de hábitats, utilizando las aves como insignia para su recuperación, y como indicador del estado ambiental del humedal.

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